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进化树的建立过程 通过测序后,在NCBI中进行BLAST比对,看和哪个属中的种最近,从而确定进化树中需比较的菌种,然后可以在权威的InternationalJournalofSystematicandEvolutionaryMicrobiology杂志中看最近是否有你要建树的菌的图,从而更捷径的得到典型的建树对比菌株(一般上标为T) 打开MEGA4在Alignment→QueryDatabanks→ 在空格处添加建树对比菌的登入号,然后直接点击上头的AddtoAlignment 3添加完对比的后,将自己测序菌株序列导入 如果拿回来后的序列是文本文档,就需要将它转化成fasta格式,其实也就是在文本文档上头加个“>”号就可以,但是序列字母必须是大写的,如果是小写的,可以在DNAman中转化成大写的(或者在EditSeq中的先全选择序列后在edit的reversecase中转变,后如下操作),并且需每列中的数字去掉,保存为fasta格式后, 在MEGA的Edit→insertsequencestofile将保存的fasta文件导入MEMA中,如果导入的序列是互补链的话,直接在添加的里面,点击导入链,右击后点击互补就行,选中所有的序列后,在Alignment选项中选中Alignbyclustalw让其自动分析后,在Date选项中输出格式选择为MEGA格式保存 4再一次启动软件将上一步保存的文件打开,然后在 如上图操作就可以得出进化树,然后在上面直接修改