SSR标记在苹果种质资源及遗传育种研究中的应用.pdf

2009年第5期

SSR标记在苹果种质资源及遗传育种研究中的应用

王娟，宋尚伟
(河南农业大学园艺学院，河南郑州450002)

摘要：SSR标记作为一种有效的分子标记手段，被广泛地应用于苹果种质资源和遗传育种研究中。
对其在苹果种质资源保存、品种鉴定、遗传多样性、遗传连锁图谱构建、基因标记及定位等方面的应
用做了简要概述。
关键词：苹果；简单序列重复；种质资源；遗传多样性；遗传连锁图谱
中图分类号：$661．1文献标识码：A文章编号：1004—3268(2009)05—0016—05

SSR(simplesequencerepeat)即简单序列重
1种质资源保存
复，通常又称为微卫星(microsatellite)，指以少数几
个核苷酸(多数为2～4个，也有报道为1～6个口])种质资源的收集和保存是遗传育种工作的基
为单位多次串联重复的DNA序列『2]，长度一般在础。但是，随着种质资源的不断收集，种质资源库变
2OObp以下。研究表明，微卫星在真核生物基因组得越来越大，这给保存、评价、研究和利用种质资源
中的含量非常丰富，而且常常是随机分布于核DNA带来了众多困难。为此，Frankel提出构建核心
中，不仅可以存在于内含子中，也可以存在于编码区种质的设想，即用科学方法从整个种质资源中选择

一
和染色体的其他任一区域。微卫星中重复单位的数部分样本，以最小的遗传资源数量，最大限度地代
目存在高度变异，这些变异表现为微卫星数目的整表整个遗传资源的多样性。核心种质的提出可解决
丰富的遗传资源材料的保存、评价、鉴定及利用带来
倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相
的困难，并有利于管理、收集、种质创新及资源的深
同，因而造成多个位点的多态性[3．4]。在真核生物
层次研究。Mcferson认为，分子标记可以用于核
中，大约每隔10～50kb就存在1个微卫星，微卫星
心种质的确定，以便以最少量的种质资源最大限度
序列两侧均为保守的DNA序列，因此可以利用和
地代表资源的遗传多样性。HokansonI1用SSR
两侧区段互补的短序列引物通过PCR扩增重复序
结合农艺性状建立了苹果的核心种质，并利用8个
列本身，然后通过聚丙烯酰胺凝胶电泳(或琼脂糖凝
SSR引物检测了66个苹果品种(系)，以确定遗传
胶电泳)显示DNA重复序列的多态性。
同一性、估算遗传稳定性，结果在66个品种(系)中
微卫星起初只是作为探针，用于真核生物基因
都发现了高水平变异，遗传同一性数据产生了一个
组的RFLP(restrictionfragmentlengthpolymor—
遗传相关性物候图，并被地理起源以及所了解的家
phism)研究。随着PCR(polymerasechainreae—
系信息所证实。
tion)技术的建立，SSR迅速应用于人类遗传]和许
多动植物研究中[6～-。SSR标记以其数量丰富、多2品种鉴定

态性高、重复性好、分布于整个基因组、特异位点扩苹果栽培历史悠久，种间杂交、无性繁殖容易，
增、发生频率高、共显性遗传等特性，已应用于果树导致个体差异不明显，同名异种或同种异名现象普
的品种鉴别、种质资源管理、遗传图谱和系谱构建以遍。用传统的形态和同工酶鉴定品种，误差大、效率
及品种保护等方面的研究口]，在苹果研究中的应低，难以鉴定性状相似的品种，分类标准也难以统

一
用尤为广泛一。为此，对SSR标记在苹果研究。SSR标记对品种的鉴定实质上是对基因型的
中的应用作一综述。鉴定，使果树品种鉴定和分类直接从DNA分子水

收稿日期：2009一o3一Ol
作者简介：王娟(1984一)，女，河南新县人，在读硕士研究生，研究方向：果树生物技术。
通讯作者：宋尚伟(1965一)，男．河南滑县人，副教授，主要从事果树生理及生物技术研究。E—mail：[e-mail]

·16·
河南农业科学

平上进行，准确度高，效率高且信息量大，易于鉴别增出163个位点，其中多态性位点74个，每对引物
同一物种的不同基因型，已成为一种有效的品种鉴的多态位点百分率为33．33％～63．16；将供试苹
定方法。果品种分为四大类群，与传统系谱分类基本一致，并
Gianfranceschi等L1叩用阳性克隆筛选出16个初步建立了一个供试苹果品种的SSR基因型图谱
新的苹果SSR引物，通过在Florida、Iduna等21个库，为建立中国苹果品种的SSR基因型数据库奠定
苹果品种上测试，16个引物中11个表现出了极好了基础。高源等[3用SSR标记对59份苹果属材料
的重复性，并且利用其中的2个引物就能区分21个进行多态性分析，只用筛选出的其中3对引物即可
品种。Guilford等利用(GA)和(GT)5作为探区分全部供试材料，通过聚类分析