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应用昆虫学报ChineseJournalofAppliedEntomology2011,48(1):167—173 SNPs分子标记技术在昆虫学研究中的应用* 董辉钱海涛柳晓利丛斌 (沈阳农业大学植物保护学院害虫生物防治研究沈阳110866) 摘要单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)主要是指在染色体基因组水平上由于单个核 苷酸的变异而引起的DNA序列多态性,包括单碱基的转换或颠换引起的点突变,其中最少出现1种等位基因 频率不小于1%,常以双等位基因的形式出现,稳定而可靠。在目前的昆虫基因组研究中,SNPs标记的研究主 要集中在果蝇、蚊媒、家蚕等一些模式生物。本文对SNPs标记在昆虫的种类鉴定、遗传图谱构建、种群遗传学、 抗药性分子机理等方面进行了综述,最后展望了SNPs在种群遗传、标记辅助选择和生物进化等研究领域中的 应用前景。 关键词单核苷酸多态性,昆虫学,DNA,遗传标记 ApplicationsofSNPsmolecularmarkersinEntomology DONGHuiQIANHai-TaoLIUXiao-LiCONGBin (LaboratoryforBio-ControlofPestInsects,CollegeofPlantProtection,ShenyangAgriculturalUniversity,Shenyang110866,China) AbstractSinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)mainlyrefertosequencepolymorphisminDNAcausedbyasingle nucleotidevariationatthegenomiclevel.Theseincludepointmutationscausedbysinglebasetransversionsor conversionsinwhichthefrequencyofonekindofalleleisnotlessthan1%.StableandreliableSNPsofteninvolvetwo alleles.TheuseofSNPsmarkersincurrentresearchoninsectgenomesisstillmainlyrestrictedtoafewmodel organisms;forexample,thefruitfly,mosquitoandsilkworm.ThispapersummarizesthetypesofSNPsmarkersusefulin entomologicalresearch,includingtaxonomy,geneticmapconstruction,populationgeneticsandelucidatingmolecular mechanismsofpesticideresistance.FutureprospectsfortheapplicationofSNPs,infieldssuchaspopulationgenetics, marker-assistedselectionandevolution,arediscussed. Keywordssinglenucleotidepolymorphisms,insectology,DNA,geneticmarkers 分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标RFLP)和微卫星标记(simplesequencerepeats, 记之后发展起来的一种新的遗传标记形式。由于SSR)之后最有前途的第三代分子标记,正在农业、 分子标记直接以DNA的形式表现,不受环境条件生物学、医学等众多学科发挥着巨大作用。近年 和发育阶段的影响,且标记的数目多,多态性高,来,伴随着昆虫DNA序列数据增加和51种昆虫 其研究与应用已得到了迅猛的发展,相继出现了全基因组测序计划的完成或部分完成(http:// 20多种DNA分子标记方法。1996年,美国麻省www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/leuks.cgi),DNA 理工学院人类基因组研究中心的Lander(1996)第序列数据库海量递增,为我们研究单个核苷酸水 一次提出单核苷酸多态性(singlenucleotide平的变异提供了前所未有的机遇(Blackand polymorphisms,SNPs)可以作为新一代的分子标Vontas,2007)。本文对SNPs标记在昆虫的种类鉴 记。目前,该标记已经成为继限制性片段长度多定、遗传图谱构建、种群遗传学、抗药性分子机理 态性(restrictionfragmentlengthpolymorp