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试剂盒特点: ◆经过特殊处理的纯化柱能有效的去除杂质和腐殖酸。 ◆兼容性强,适用于各种不同的粪便。 ◆不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。 ◆快速,简捷,单个样品操作一般可在60分钟内完成。 ◆高纯度,OD260/OD280典型的比值达 1.7~ 1.9,长度可达50kb以上,可直接用于PCR, 1.DNA提取中会污染任何物质蛋白糖类RNA等。其纯度一般用核算吸收 OD260/OD280(蛋白质污染)分析判断,纯DNA比值为 1.8。此外用OD280/OD230估计盐离子是不是太高。 5.分光光度分析DNA的A280/A260小于 1.8;不纯,含有蛋白质等杂质。在这种情况下,应加入SDS至终浓度为 0.5%,并重复步骤2~8。 你取出1微升或2微升,用EB稀释100倍或50倍到100微升,的比值在 1.8- 2.0是比较理想的,代表你的DNA纯度很高。波长260nm时,1OD值相当 于双链DNA浓度为50μg/ml,算一下,再乘以你的稀释倍数,就是浓度了 紫外吸收检测DNA浓度与纯度 2007年11月13日星期二11:40目的: 了解紫外吸收检测DNA浓度与纯度的原理,掌握测定方法。原理: 1/14 核酸的最大吸收波长为260nm,蛋白质为280nm,在波长260nm时,1OD 值相当于双链DNA浓度为50μg/ml,单链寡核苷酸的含量为30μg/ml,可以据此 来计算核酸样品的浓度,还可通过测定在260nm和280nm的OD值的比值 (OD260/OD280),估计核酸的纯度。纯净DNA的比值为 1.8,RNA为 2.0。若比值高于 1.8说明DNA样品中的RNA尚未除尽,若样品中含有酚和蛋白质将导致比 值降低。270nm存在高吸收表明有酚的干扰。紫外分光光度法只能用于测定浓 度大于 0.25μg/ml的核酸溶液,对浓度更小的样品,可采用荧光分光光度法。试剂 与仪器: 提取的质粒DNA,紫外分光光度仪。操作步骤:1)分光光度计先用水在 260nm和280nm两个波长下校零。2)取质粒DNA样品2μl,用水稀释100倍, 转入分光光度计的石英比色杯中。3)在260nm和280nm分别读出样品光密度 值。如果样品浓度单位为μg/μl,则样品DNA浓度为OD值的10倍,即如 OD<SUB>260</SUB>= 0.1,则样品浓度即为1μg/μl。4)若 OD<SUB>260</SUB>/OD<SUB>280</SUB>大于 1.8,说明仍有RNA,可以考虑用RNA酶处理样品,若小于 1.8,说明样品中含有蛋白质或酚,应再用酚/氯仿抽提,以乙醇沉淀纯化 DNA。 先说下吸光度和比值的意义。 A280nm是蛋白和酚类物质最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品 纯度评估: 纯DNA的A260/A280比值为 2/14 1.8,纯RNA为 2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化 样品。比值= 1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液; A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度 评估: 纯DNA和RNA的A260/A230比值为 2.5。若比值小于 2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样 品。A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的一些其他成分的干 扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校 正。 A260/A280和A260/A230是核酸纯度的指示值,纯度好的DNA,在pH7- 8.5下其比值应该在 2.0或 2.5,A260/A280的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是280 nm。纯净的样品比值大于 1.8(DNA)或者 2.0(RNA)。 如果比值低于 1.8或者 3/14 2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230是多肽、芳香基团、苯酚 和一些碳氢化合物的吸光度,A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合 物、多肽、苯酚等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于 2.0。 A280是蛋白质的吸光度。 我的建议: 将所提取的DNA跑琼脂糖凝胶电泳,然后回收纯化一下。 另提供一种CTAB改进法配方: 组份Tris-HCl(pH 8.0)EDTA(pH 8.0)NaClCTAB PVP40β-巯基乙醇 终浓度100mM20mM 1.4M3%(W/V) 5%(W/V)2%(V/V)使用前加入 A260/A280< 1.8时,蛋白质含量偏高; 1.8<A260/A280< 2.0时,样品较纯;A260/A280>