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第23卷第6期中国生物医学工程学报V0J.23No.6 2004年12月CHINESEJOI『RNAIOFBIOMEDICALENGEER『GDecember 文章编号:0258—8021(2004)一06—479—07 基于薄板样条的Mill图像与脑图谱的配准方法 罗述谦,阎华 (首都医科大学生物医学工程学院,北京~ooo54) 为了将CT、MRI、PET或SPECT等断层扫描图像用于疾病的辅助诊断、放射治疗、手术计划和引导,就必须知道图 像中感兴趣区(R0I)是什么解剖组织,即解决医学图像的解剖标识问题。 医生通常是从解剖书籍、图谱及自身经验来对ROI做出判断。这些书籍和图谱往往给出的是文字描述和有限 数目的,固定位置和方向的断层图片,很难与患者的实际图像联系起来。对于缺乏临床经验的医生来说尤为困难。 数字化3D人脑解剖图谱使医生对人脑深部组织全方位可视化。因此可以将其通过一定的空间变换,与MR体积数 据集中的ROI进行比较,从而得到ROI的解剖标识。但是,没有两个人的大脑是完全一样的。人脑的解剖个体差异 较大,这就要求利用非线性变形的方法做解剖标识。本研究介绍通过薄板样条变换用Talirach脑图谱对MR图像做 解剖标识的方法。 关键词:脑图谱;MR图像;解剖;标识 中图分类号:TP391.41文献标识码:A 引言 随着计算机技术的不断发展,有越来越多的不同成像模式可以用来产生反映人体组织、器官性能的医 学图像,例如反映人体结构形态的CT,区分脑部软组织的MRI,及反映组织功能的PET和SPECT图像等。为 了疾病的辅助诊断、放射治疗、手术计划和引导,都必须知道图像中感兴趣区(ROI)是什么解剖组织。医生 通常是从解剖书籍、图谱及自身经验来对ROI做出判断。这些书籍和图谱往往给出的是文字描述和有限数 目的。固定位置和方向的断层图片,很难与患者的实际图像联系起来。对于缺乏临床经验的医生来说尤为 困难。数字化3D人脑解剖图谱使医生对人脑深部组织全方位可视化。CT、MRI、PET和SPECT图像都是断 层扫描图像,因此可以从体积数据集进行3D重建,得到立体显示。对重建图像中的ROI则可通过一定的空 间变换,与3D人脑解剖图谱进行比较,从而得到ROI的解剖标识。但是,没有两个人的大脑是完全一样的。 人脑的解剖个体差异较大,即使健康人也是如此。本研究以MRI图像为例,介绍如何从中提取ROI,并通过 非线性变形的方法用Talirach脑图谱做解剖标识的方法。 1方法 1.1MRI图像RoI提取 首先用大津阈值法将脑与背景分开,将背景置为O,非背景置为1,得到二值图像。然后对二值图像进行 形态学运算,得到图像的边界。此外,对于某些结构,如第三脑室等,采用区域生长法提取其边缘。 (1)用大津阈值法区分目标和背景区 大津阈值法可以自动寻找阈值,对图像进行划分,将目标物和背景区分开来⋯。把直方图在某一阈值 处分割成两组={1~k}和C1={k+1一m},两组总方差用下式求出 d()=cO0(。一)+cO1(一)=co0∞(1一po)={(1) 基金项目:国家自然科学基金资助项目(30270401);国家高技术研究发展计划(863)资助项目(21X/2AA23121) 收稿日期-'2002—01—08;修回日期:2004—10—16 480中国生物医学工程学报第23卷 其中=∑it,l是整体图象的灰度平均值;()=ipi是阈值为|j}时的灰度平均值,()是c0产生 的概率。当被分成的两组总方差为最大时,值便是阈值。 矿=argmara()(2) (2)数学形态学方法提取边缘 用大津阈值法处理后,得到二值图像,背景象素为0,脑部象素为1。然后进行数学形态法操作,可以提 取图象的边界。常用的数学形态学运算包括腐蚀、膨胀、开和闭等E2]。二值腐蚀和膨胀是最基本的形态学 运算,有多种定义的方法。本研究采用如下定义方法。 集合A被集合B腐蚀,表示为AOB,其定义为 AOB={I(B)A} 该运算的含义是,结构元素B平移至点x后仍在A中,或B完全包含在A中时,B的原点处像素点X的集合。 腐蚀操作具有收缩图像的作用。对于互相粘接的颗粒图像,利用腐蚀运算可以将它们分开。 膨胀表示为A0,其定义为 A0B:{I[(台)nA]≠} 含义是,先对结构元素B关于自身原点做映射,得到(台)。再将其平移至点X与A的交集不为空集的像素 点x的集合。也就是说,§位移后与A至少有一个非零元素相交时,B的原点位置的集合。用圆结构元素对 图像进行膨胀操作相当于各向同性的增大或扩张,可以填充图像中的小孔及在图像边缘中的小凹陷部分。 对于图像A和圆盘,运算(A0B)\A给出A 的外边界;A\(AOB)给出A的内边界。对MR图象 用数学形态学方