水稻ILP标记遗传图谱的构建.pdf

HEREDITAS(Beijing)2008年2月,30(2):225―230
ISSN0253-9772www.chinagene.cn研究报告

DOI:10.3724/SP.J.1005.2008.00225

水稻ILP标记遗传图谱的构建

赵向前1,2,吴为人1

1.浙江大学农业与生物技术学院,杭州310029;
2.浙江省嘉兴市农业科学研究院,嘉兴314016

摘要：内含子长度多态性(ILP)是一种基于PCR的新型分子标记,具有许多突出的优点。我们先前利用已公布
的籼稻品种93-11和粳稻品种日本晴的基因组序列数据,已开发了172个水稻ILP标记。为了检验这些ILP标

记的可靠性及其在遗传作图中的可用性,利用一个BC1F1(日本晴/93-11//日本晴)群体,构建了一张含172个ILP
标记座位和13个SSR标记座位的水稻遗传图谱,总长度为1905.7cM。比较显示,图谱上所有标记的顺序与其
物理顺序完全一致,证明了利用ILP标记进行遗传作图的可行性和有效性。文中还对标记偏分离现象进行了分
析,发现在第6号染色体短臂上存在一个严重偏分离的区域。

关键词：水稻;ILP标记;遗传图谱

ConstructionofageneticmapbasedonILPmarkersinrice
ZHAOXiang-Qian1,2,WUWei-Ren1
1.CollegeofAgricultureandBiotechnology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310029,China;
2.JiaxingAcademyofAgriculturalScience,Jiaxing314016,China

Abstract:Intronlengthpolymorphism(ILP)isanewtypeofPCR-basedmolecularmarkerswithmanyadvantages.Wehad
previouslydeveloped172ILPmarkersinriceusingthepublishedgenomesequencedataofindicacultivar93-11andja-
ponicacultivarNipponbare.InordertoexaminethereliabilityandtheapplicabilityoftheseILPmarkerstogeneticmap-
ping,weconstructedaricegeneticmapconsistingof172ILPand13SSRmarkerswithatotallengthof1905.7cMusinga

BC1F1(Nipponbare/93-11//Nipponbare)population.Comparisonshowedthattheorderofthemarkersinthismapwasex-
actlythesameastheirphysicalorder,verifyingthefeasibilityandefficiencyofusingILPmarkersforgeneticmapping.We
alsoinvestigatedthephenomenonofmarkersegregationdistortionandfoundaregionofserioussegregationdistortionin
theshortarmofchromosome6.

Keywords:rice;ILPmarker;geneticlinkagemap

水稻是最重要的粮食作物之一,也是禾本科基连锁图。之后,相继报道了多张水稻RFLP图谱[3~5]。
因组研究的模式植物[1]。水稻遗传图谱的构建较早然而,由于RFLP标记在技术上比较烦琐且费用较高,
受到重视,迄今已构建了多幅相当饱和的分子标记因而限制了RFLP图谱在育种上的应用。2000年以来,
连锁图。1988年McCouch等[2]用135个限制性片段高效实用的微卫星(SSR)标记在水稻中得到了大量
长度多态性(RFLP)标记构建了第一张水稻分子标记的开发,成为水稻遗传图谱构建的主要分子标记

收稿日期:2007−08−22;修回日期:2007−10−25

基金项目:国家高新技术研究发展计划项目(863技术)(编号:2006AA10Z1E2)[SupportedbytheNationalHigh-TechResearchandDevelopment
ProgramofChina(No.2006AA10Z1E2)]

作者简介:赵向前(1975−),男,浙江人,博士,研究方向：植物遗传学。Tel:[phone];E-mail:f