基于SSR分子标记技术的长豇豆种子纯度快速鉴定技术图文百精.doc

浙江农业学报ActaAgriculturaeZhejiangensis22(6:727~730,2010
基于SSR分子标记技术的长豇豆种子纯度快速鉴定技术
鲁忠富,徐沛,汪宝根,刘永华,吴晓花,胡婷婷,李国景
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(浙江省农业科学院蔬菜研究所,浙江杭州310021
收稿日期:2010-06-17
基金项目:浙江省科技厅重大优先主题项目(2008C120031作者简介:鲁忠富(1963-,男,浙江杭州人,农艺师,主要从事蔬菜育种和栽培技术研究工作。Emai:[e-mail];Te:l057186404223
*通讯作者,李国景,Emai:[e-mail];Tel(摘要:当前生产上应用的长豇豆品种众多,且商业品种间的遗传相似性愈来愈高,种子质量纠纷时有发生。本研究以44份核心长豇豆种质为试材,利用普通豇豆DNA序列信息,通过生物信息学方法自主设计开发适用于长豇豆研究的SSR引物,从中筛选出10对诊断性引物,在此基础上建立基于SSR分子标记技术的长豇豆种子纯度快速检测方法,可满足长豇豆种子产业化的需要。关键词:长豇豆;SSR;纯度鉴定;遗传指纹图谱中图分类号:S6434文献标识码:A
文章编号:1004-1524(201006-0727-04
ArapidandpreciseSSRbasedprocedureforseedqualitysurveyingofVignaunguiculatassp.sesquipedalis(L.Verd.
LUZhongfu,XUPe,iWANGBaogeng,LIUYonghua,WUXiaohua,HuTingting,LIGuojing
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(InstituteofVegetables,ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences,Hangzhou310021,China
Abstract:Currentapplicationoflargenumberofcommercialasparagusbeancultivarswithveryhighgeneticsimilaritycausedmoreandmoredisputesonseedquality.Inthisresearch,asetofSSRmarkersforasparagusbeanweredevelopedbasedonabioinformaticsbasedapproach.Tenofthesemarkersweredefinedasdiagnosticmarkersbygenotypingacorecollectionofasparagusbeanconsistingof44lines.Basedonthis,arapidandpreciseSSRbasedprocedureforasparagusbeanseedqualitysurveyingwasestablished,whichwouldmeetthedemandofrapidlydevelopingasparagusbeanindustry.
Keywords:asparagusbean;SSR;puritysurveying;geneticfingerprint
长豇豆(Vignaunguiculatassp.sesquipedalis(L.Verd.嫩荚供食,是我国重要的夏季豆类蔬菜之一。我国从事长豇豆育种、种子生产和经营的科研院所、企业众多。当前生产上应用的长豇豆品种众多,年用种量大,商业品种间的遗传相似性愈来愈高,同种异名、同名异种现象日益严重,种子质量纠纷时有发生。目前我国蔬菜品种真伪与纯度鉴定大多依靠田间表现型鉴定,鉴
定所需时间长(一般需50~60d,并受季节的限制,而且作物的表现型易随环境条件的变化而变化,特别是对于一些形态差异较小的品种间鉴定难度更大。因此,很有必要研究开发一种能早期、周年、快速、准确鉴定长豇豆品种真伪和纯度的检测方法。
DNA分子标记技术在国内外已被用于鉴别不同品种之间在分子水平上的差异
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。由于
在同一物种的各个品种间存在有大量的多态性标记,每一品种均存在有区别于其他品种的独特标记,即一些特异性DNA片段,称为该品种的指纹,各品种独特的指纹片段组合构成该物种的DNA指纹图谱。与传统的依据表型性状鉴定相比,
以在植株生长的任何阶段进行,鉴定快速,并不受基因表达和环境条件的影响等优点。
SSR分子标记技术利用真核生物基因组中存在的大量微卫星重复序列设计引物,通过PCR扩增串联的重复序列,并依据微卫星的重复次数在同一物种不同基因型间的差异揭示长度多态性[4]。SSR由于分布广、稳定性和多态率高,操作简单、重复性好、对DNA质量要求较低等,被誉为第二代分