一种整合神经影像数据分析环境的构建方法及系统.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN113835832A(43)申请公布日2021.12.24(21)申请号202111030312.3(22)申请日2021.09.03(71)申请人广州中医药大学第一附属医院地址510405广东省广州市白云区机场路16号(72)发明人黄浩明邱士军马小猛乐晓梅康尚煜黄浩钧赵玮璇谭欣陈羽娜饶雅雯(74)专利代理机构深圳国海智峰知识产权代理事务所(普通合伙)44489代理人王庆海刘军锋(51)Int.Cl.G06F9/455(2006.01)权利要求书2页说明书6页附图3页(54)发明名称一种整合神经影像数据分析环境的构建方法及系统(57)摘要本发明涉及神经影像处理技术领域，具体公开了一种整合神经影像数据分析环境的构建方法及系统，方法包括根据预设的Dockerfile构建docker镜像；根据docker镜像创建一个容器；在已创建的容器中，通过控制取消指令取消宿主机的访问控制，使容器内图形化界面能够正确显示于宿主机上；按照预设保存格式以及预设保存路径，将docker镜像进行备份保存；将已经构建及备份好的docker镜像根据解压指令进行解压，以标准输出通过管道传入加载指令中进行镜像加载等步骤。本发明简化神经影像数据分析处理环境的搭建及部署流程，达到一键式构建、运行、备份以及部署稳健的、可重复的、可用于机器学习、深度学习的神经影像数据处理环境的目的。CN113835832ACN113835832A权利要求书1/2页1.一种整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，包括：镜像构建：根据预设的Dockerfile构建docker镜像；容器建立：根据所述docker镜像创建一个容器；容器运行：在已创建的容器中，通过控制取消指令取消宿主机的访问控制，使容器内图形化界面能够正确显示于宿主机上；镜像备份：按照预设保存格式以及预设保存路径，将所述docker镜像进行备份保存；镜像恢复：将已经构建及备份好的所述docker镜像根据解压指令进行解压，以标准输出通过管道传入加载指令中进行镜像加载。2.如权利要求1所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，还包括：在所述容器中对神经影像数据进行处理，输出神经影像数据处理分析结果。3.如权利要求1所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，所述Dockerfile为通过预选软件的类型统一制定的。4.如权利要求3所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，指定镜像所用的运行时库；所述运行时库为normal或者nvidia；根据Dockerfile的配置下载对应所述预选软件，并在临时容器中进行编译。5.如权利要求1所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，所述docker镜像以人工智能机器学习算法为框架，以python为开发语言环境，整合神经影像分析处理软件及工具。6.如权利要求5所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，所述神经影像分析处理软件及工具包括结构像处理软件、结构像分割软件、弥散像处理软件、功能像处理软件、泛用神经影像软件中的一种或多种。7.如权利要求1所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，将所述docker镜像进行备份保存时，预设保存格式为tar.gz格式。8.如权利要求1所述的整合神经影像数据分析环境的构建方法，其特征在于，根据所述docker镜像创建一个容器，包括：根据容器启动配置文件，获取宿主机上当前用户的UID及GID；在容器中新建一个同名用户，使得容器内文件读写执行权限与宿主机一致；将宿主机的$HOME目录挂载至容器的同名目录下；将宿主机的/tmp/.X11‑unix目录挂载至容器的同名目录下。9.一种整合神经影像数据分析环境的构建系统，其特征在于，所述系统包括镜像构建模块、容器建立模块、容器运行模块、镜像备份模块、镜像恢复模块，其中：所述镜像构建模块，与所述容器建立模块、镜像备份模块相连接；所述镜像构建模块用于根据预设的Dockerfile构建docker镜像；所述容器建立模块，与所述镜像构建模块、容器运行模块相连接，所述容器建立模块用于根据所述docker镜像创建一个容器；所述容器运行模块，与所述容器建立模块相连接，所述容器运行模块用于在已创建的容器中，通过控制取消指令取消宿主机的访问控制，使容器内图形化界面能够正确显示于宿主机上；所述镜像备份模块，与所述镜像构建模块、镜像恢复模块相连接，所述镜像备份模块用2CN113835832A权利要求书2/2页于按照预设保存格式以及预设保存路径，将所述docker镜像进行备份保存；所述镜像恢复模块，与所述镜像备份模块相连接，所述镜像恢复模块用于将已经构建及备份好的所述docker镜像根据解压指令