生物信息学论文：浅谈在生物信息学教学中的学科统一性.doc

生物信息学论文：
浅谈在生物信息学教学中的学科统一性
摘要：大学的科研与教学有着不可分离的关系。大学的科研一直在引导着教学，同时，教学也在督促着科研。科研需要通过教学把对整体的认知过程传达给学生，而教育的目的是唤起学生一种科学的统一性的意识，并借此培养一种清晰的自我意识。生物信息学是一门新兴的交叉学科，有它自身鲜明的特征。目前，如何在生物信息学教学中体现学科统一性仍然是一个未解决的课题。本文结合生物信息学的特点，初步分析了生物信息学教学与科研的关系，并探讨了如何在教学中体现出这门交叉学科的统一性。Abstract:Universityresearchhasacloserelationshipwithteaching.Theresearchleadstheteaching，atthesametime，theteachingalsourgestheresearch.Theresearchconveysthewholecognitiveprocesstostudentsthroughteachingwhilethepurposeofeducationistoarousestudents'scientificunityawarenessandcultivateakindofclearselfawareness.Bioinformaticsisaburgeoningcrossdisciplinewithitsdistinctivefeatures.Atpresent，itisstillanunresolvedissueofhowtoembodysubjectunityatbioinformaticsteaching.Combiningthecharacteristicsofbioinformatics，thepaperpreliminarilyanalyzestherelationofbioinformaticsteachingandresearchandexploreshowtoembodythiscrossdiscipline'sunityinteaching.关键词：生物信息学；教学；科研；统一性Keywords:bioinformatics；teaching；research；unity
1以真理为业的教师按照雅斯贝尔斯的说法，“大学应当成为这样的一个地方，在这里人们可以不受限制的探求真理，并在对真理的追求中培养清晰的自我意识”[1]。生物信息学像所有的学科一样，首先要传达出一种以真理为业的精神。以韦伯的《以学术为业》的著名演讲为例[2]，可知这样一种精神的传达所具有的不可替代的价值。2在教学中传达生物信息学的整体性2.1生物信息学是门学科而不是工具。生物信息学最开始是为了处理基因组计划产生的大量数据而诞生的，所以总是被认为是一门工具。现在的生物信息学正由过去的分析和积累生物分子的知识转变为综合多种生物分子及其相互作用的知识来了解生物系统的功能[3]。日本学者MinoruKanehisa把生物信息学分为基因组信息学和后基因组信息学两个阶段，基因组信息学是为了处理基因组计划产生的大量数据而诞生的，它的角色是通过对生物分子的分析支持实验工作；后基因组信息学的研究可能使我们进入到对生命的基本规律的认识[3]。正是因为后基因组信息学的出现，使得生物信息学有了作为一门学科的资本。2.2生物信息学是一个整体。当把生物信息学作为一个工具时，它确实是各个不同学科的堆砌。然而，当我们的研究层次可以从单个基因和蛋白质过渡到网络，甚至全基因组的相应时，当我们注意到细胞随着时间和空间而受到动态的调控而基因也不再是静态的实体时，当我们从整个生命之树的角度处理大量信息时，生物信息就成了一个主导的整体，而不只是各个工具的堆砌[4]。它成了一门“理论”的生物学。3生物信息学教师的科研能力的培养从真理和求知意志的统一性上来说，科学就是哲学，是通过一种“明确而严密”的方式，体现了哲学上的冲动。教育的目的，正是要把这样一种激情和研究的方式传播给其他人。教师在讲台上的作用，不只是他说讲解和组织起来的各种知识，他的对于科学的激情和逐步探索的过程会对学生有很大的感染力。从康德到韦伯所做的经典讲座都表明，演讲者不经意间流露出的“可意会不可言传”的东西，对于讲课的效果有关键的影响。如果教师不具备科研精神和一种探索中的冒险精神，他的内容无论组织得多有条理，无论以多么精确的确定性得出令人赏心悦目的数字，也会导致教学的失败[1]。因此，生物信息学的教师应该首先超越把生物信息学作为工具的想法，培养对于客观性的忠诚以及一种为真理统一性献身的热忱。生物信息学不同于其他学科，它没有别人组织好的教学材料，它的很多最新成果必须教师自己去整理和总结，这就更凸显了生物信息学的教师必须同时是生物