一种检测鸡CDS2基因3’‑UTR变异的方法.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN107099587A(43)申请公布日2017.08.29(21)申请号201710288071.X(22)申请日2017.04.27(71)申请人河南农业大学地址450002河南省郑州市金水区文化路95号(72)发明人黄艳群徐媛媛陶亚飞陈文(74)专利代理机构郑州优盾知识产权代理有限公司41125代理人孙诗雨张真真(51)Int.Cl.C12Q1/68(2006.01)C12Q1/48(2006.01)权利要求书1页说明书7页序列表2页附图1页(54)发明名称一种检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法(57)摘要本发明属于分子生物学技术领域，涉及一种检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法。步骤如下：资源群体样品的准备；样品基因组DNA的提取；DNA混合池的构建；引物的设计；3’-UTR变异的检测；统计检测结果并进行基因型判型，揭示了CDS2基因在鸡的生长发育方面存在着重要的效应，通过选择淘汰CDS2基因G4971A位点的AG杂合子，有利于提高群体的6周龄体重和腿肌重，具有作为鸡的育种中利用基因型进行鸡的体重选择的应用。CN107099587ACN107099587A权利要求书1/1页1.一种检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于，步骤如下：（1）资源群体样品的准备；（2）样品基因组DNA的提取；（3）DNA混合池的构建；（4）引物的设计；（5）3’-UTR变异的检测；（6）统计检测结果并进行基因型判断。2.如权利要求1所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于：所述步骤（1）的操作为，采用正交试验法，正交系4个、反交系3个，F0代是从蛋肉兼用型固始鸡和肉用型安卡红鸡纯系中分别选取种鸡，按公母鸡1∶6比例配组而成；从每个家系的F1后代中选留1只公鸡，每只公鸡分别按公母鸡1∶9比例与选留公鸡不同的F1代家系的F1代母鸡交配，产生F2代，以F2代个体为样品。3.如权利要求1所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于：所述步骤（2）的操作为，采用酚氯仿抽提法从F2代个体样品的血液中提取基因组DNA。4.如权利要求1所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于：所述步骤（3）的操作为，选取100个不同个体的F2代样品的DNA，每个样品的DNA取2μL，充分混匀即可完成DNA混合池的制备。5.如权利要求1所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于：所述步骤（4）中，引物为检测变异位点的引物对LP5-F和LP5-R，其中LP5-F序列如SEQIDNO：1所示，LP5-R序列如SEQIDNO：2所示。6.如权利要求1所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于：所述步骤（5）中，3’-UTR变异的检测包括PCR产物检测和酶切片段检测。7.如权利要求6所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，其特征在于：所述酶切片段检测采用的酶切引物对为LP6-F和LP6-R，其中LP6-F序列如SEQIDNO：3所示，LP5-R序列如SEQIDNO：4所示。8.如权利要求1-7任一项权利要求所述的检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法，作为鸡的育种中利用基因型进行鸡的体重选择的应用。2CN107099587A说明书1/7页一种检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法技术领域[0001]本发明属于分子生物学技术领域，涉及一种检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法。背景技术[0002]CDP-甘油三酯合成酶(CDP-diacylglycerolsynthases，CDS)是催化磷脂酸形成CDP-甘油三酯(CDP-DAG)的关键酶。而磷脂酸和CDP-DAG在细胞功能中都起着重要的作用。磷脂酸在一些信号传导通径中发挥作用，而且在结构和生物合成中也发挥着作用。而CDP-DAG是磷脂酰肌醇(PI)，磷脂酰甘油(PG)，和心磷脂(CL)等磷脂物质的脂质前体。目前两种CDS被鉴定CDS1和CDS2。CDS2广泛表达，被发现在几乎所有组织显示其对机体具有重要功能。CDS2是一个蛋白编码基因，其通路与代谢和甘油磷脂生物合成有关，Go分析将这个基因与转移酶活力、转移含磷基团和磷酸二胞苷酰基转移酶等功能联系起来。显示该基因在能量代谢等方面的功能。在斑马鱼，干扰了CDS2导致减少了血管生长因子(VEGFA)信号的水平和血管再生，主要通过降低PIP2的再生水平。目前关于鸡CDS2的研究尚未见报道。发明内容[0003]本发明为解决揭示通过鸡CDS2基因的基因型选择提高鸡的体重的技术问题，公开了一种检测鸡CDS2基因3’-UTR变异的方法。[0004]为解决上述技术问题，采用以下技术方案：[0005]一种检测