重楼属药用植物DNA 条形码鉴定研究.pdf

·376·药学学报ActaPharmaceuticaSinica201045(3):376-382重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究朱英杰12陈士林2姚辉2*谭睿1*宋经元2罗焜3鲁静4(1.西南交通大学生命科学与工程学院四川成都610031;2.中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所北京100193;3.湖北中医学院药学院湖北武汉430061;4.中国药品生物制品检定所北京100050)摘要:为评价DNA条形码候选序列对重楼属药用植物的鉴定作用探讨重楼属药用植物鉴定新方法本研究对重楼属11个物种17份样品的psbA-trnH、rpoB、rpoC1、rbcL、matK和核ITS2序列进行PCR扩增和测序比较各序列扩增和测序效率、种内和种间变异进行barcodinggap分析采用BLAST1和NearestDistance方法评价不同序列的鉴定能力。结果显示ITS2序列在所研究的重楼属药用植物中的扩增和测序效率均为100%其种内种间变异、barcodinggap与其他DNA条形码候选序列相比具有明显的优势ITS2序列在重楼属中的鉴定成功率达到100%而生物条形码协会(CBOL)植物工作组推荐的matK和rbcL序列的鉴定成功率分别为52.9%和5.9%二者联合鉴定能力没有提高对于ITS2序列扩大至29个物种67份样品依然具有100%的鉴定成功率。实验结果表明ITS2序列能够准确鉴定重楼属药用植物可以作为潜在的药用植物通用条形码序列。关键词:重楼属;DNA条形码;ITS2;药用植物;鉴定中图分类号:R931.5文献标识码:A文章编号:0513-4870(2010)03-0376-07DNAbarcodingthemedicinalplantsofthegenusParisZHUYing-jie12CHENShi-lin2YAOHui2*TANRui1*SONGJing-yuan2LUOKun3LUJing4(1.SchoolofBioscienceandEngineeringSouthwestJiaotongUniversityChengdu610031China;2.InstituteofMedicinalPlantDevelopmentChineseAcademyofMedicalSciences&PekingUnionMedicalCollegeBeijing100193China;3.SchoolofPharmacyHubeiUniversityofChineseMedicineWuhan430061China;4.NationalInstitutefortheControlofPharmaceuticalandBiologicalProductsBeijing100050China)Abstract:DNAbarcodingisatechniqueinwhichspeciesidentificationanddiscoveryareperformedbyusingshortandstanda