一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN114807384A(43)申请公布日2022.07.29(21)申请号202210390874.7(22)申请日2022.04.14(71)申请人华南农业大学地址510642广东省广州市天河区华南农业大学(72)发明人张细权符蓉梁佳莹任团辉李王钰李秋梅(74)专利代理机构北京东方盛凡知识产权代理事务所(普通合伙)11562专利代理师张换君(51)Int.Cl.C12Q1/6888(2018.01)C12Q1/6858(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表2页附图2页(54)发明名称一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其应用(57)摘要本发明公开了一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其应用，属于分子生物技术和分子标记技术领域。本发明公开一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。本发明实验结果显示：本发明的SNP分子标记，位于鸡9号染色体APOD基因5‘‑侧翼区基因序列中的突变位点g.12360333G>T和g.12360387T>C，与鸡胫爪重和心肝肌胃腺胃重性状相关，是新的分子标记。通过优选该SNP位点的优势基因型，对鸡屠体性状进行早期选择，不仅可以节省生产成本，还能加快遗传进展，将其应用于鸡的育种中，具有很大的经济应用价值。CN114807384ACN114807384A权利要求书1/1页1.一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示。2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的突变位点的基因型包括GG、GT、TT、TC和CC。3.根据权利要求2所述的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的突变位点为鸡基因组9号染色体上第12360333bp处的G>T突变或第12360387bp处的T>C突变。4.一种利用权利要求1‑3任一项所述的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法，其特征在于，包括利用所述SNP分子标记早期筛选鸡的胫爪重和心肝肌胃腺胃重性状的过程。5.根据权利要求4所述的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法，其特征在于，利用PCR技术进行扩增所述SNP分子标记。6.根据权利要求5所述的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法，其特征在于，所述PCR所用到的扩增引物为：F：TTGAGCACACTGAGGGTC；R：CGTACTGGTGGGAAACAGA。7.根据权利要求5所述的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法，其特征在于，所述PCR扩增体系包括：PCRMix5.0μL，两条引物各0.3μL，DNA1.0μL和水3.4μL。8.根据权利要求5所述的SNP分子标记早期筛选鸡屠体性状的方法，其特征在于，所述PCR扩增程序包括：98℃预变性5min，98℃变性5s，58℃退火10s，72℃延伸10s，72℃后延伸5min，4℃保存，共34个循环。9.一种鸡的遗传改良的方法，其特征在于，包括以下步骤：先利用权利要求1所述的分子标记繁育出新的品系；再将所述新的品系作为种鸡，逐代提高优势等位基因型的频率；最后得到已经改良了胫爪重性状和心肝肌胃腺胃重性状的鸡。10.权利要求1‑3任一项所述的SNP分子标记在筛选鸡屠体性状中的应用。2CN114807384A说明书1/6页一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其应用技术领域[0001]本发明涉及分子生物技术和分子标记技术领域，特别是涉及一种与鸡屠体性状相关的SNP分子标记及其应用。背景技术[0002]ApoD是一种独特的载脂蛋白，1963年，ApoD在人血浆中首次被发现，最初被确定为高密度脂蛋白的一个组成部分，1973年首次从人血浆中分离出来，随后被证明是脂质运载蛋白家族的一员。ApoD不像其他载脂蛋白主要产生于血浆中，它主要存在于高密度脂蛋白(HDL)中，在极低密度脂蛋白(VLDL)中较少。ApoD可以结合胆固醇、孕酮、孕烯醇酮、胆红素和花生四烯酸。目前已经在人类、猴子、猪、兔、大鼠、小鼠和鸡等几种脊椎动物中鉴定出ApoD。研究指出，APOD基因在胚胎和成体的生长、发育和分化、肿瘤细胞的发生、发展和凋亡、抵抗外界环境胁迫、维护机体脂质稳态平衡以及在一些神经系统的发生、损伤修复以及紊乱和疾病中发挥重要作用。[0003]目前，在脊椎动物和人的研究中都已确定APOD基因与脂蛋白代谢有关。研究发现APOD与阿尔茨海默氏病(AD)和帕金森的发病机理有关。在动物研究中，发现APOD对家蚕的蜕皮调控机制有影响；2005年，发现鸡APODmRNA在皮肤中表达是心脏中的246.48到38.44倍；研究报道APOD基因是鸟类胡萝卜素着色的候选基因；此外，还发