一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115807115A(43)申请公布日2023.03.17(21)申请号202210970823.1(22)申请日2022.08.13(71)申请人云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所地址650205云南省昆明市盘龙区北京路2238号(72)发明人陈玲程在全肖素勤王波张云王玲仙殷富有钟巧芳张敦宇柯学刘丽李金璐卢源达余腾琼蒋聪(74)专利代理机构云南凌云律师事务所53207专利代理师康珉(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书5页说明书20页序列表（电子公布）附图9页(54)发明名称一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用(57)摘要本发明涉及一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记扩增引物组合及其应用，开发了72对扩增引物，其对应的72个InDel分子标记均匀分布在水稻12条染色体上，每条染色体有6个InDel分子标记。本发明可为检测药用野生稻或药用野生稻与栽培稻之间的分子多态性，以及药用野生稻中优良基因的定位或导入栽培稻后的选育提供低成本、高效率的标记资源，本发明开发InDel分子标记及其扩增引物的方法，在不经过药用野生稻和栽培稻的基因组测序情况下，能在较短时间内大量发展出区分用于检测药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记，克服了药用野生稻中优异基因发掘利用困难的现状。CN115807115ACN115807115A权利要求书1/5页1.一种用于区分药用野生稻与栽培稻的InDel分子标记的InDel引物组合，其特征在于，所述InDel引物组合由72对InDel引物组成，每对InDel引物由正向引物和反向引物组成，72对InDel引物的编号为InDel1引物至InDel72引物，具体是：InDel1引物由SEQIDNO：1所示的InDel1正向引物和SEQIDNO：2所示的InDel1反向引物组成；InDel2引物由SEQIDNO：3所示的InDel2正向引物和SEQIDNO：4所示的InDel2反向引物组成；InDel3引物由SEQIDNO：5所示的InDel3正向引物和SEQIDNO：6所示的InDel3反向引物组成；InDel4引物由SEQIDNO：7所示的InDel4正向引物和SEQIDNO：8所示的InDel4反向引物组成；InDel5引物由SEQIDNO：9所示的InDel5正向引物和SEQIDNO：10所示的InDel5反向引物组成；InDel6引物由SEQIDNO：11所示的InDel6正向引物和SEQIDNO：12所示的InDel6反向引物组成；InDel7引物由SEQIDNO：13所示的InDel7正向引物和SEQIDNO：14所示的InDel7反向引物组成；InDel8引物由SEQIDNO：15所示的InDel8正向引物和SEQIDNO：16所示的InDel8反向引物组成；InDel9引物由SEQIDNO：17所示的InDel9正向引物和SEQIDNO：18所示的InDel9反向引物组成；InDel10引物由SEQIDNO：19所示的InDel10正向引物和SEQIDNO：20所示的InDel10反向引物组成；InDel11引物由SEQIDNO：21所示的InDel11正向引物和SEQIDNO：22所示的InDel11反向引物组成；InDel12引物由SEQIDNO：23所示的InDel12正向引物和SEQIDNO：24所示的InDel12反向引物组成；InDel13引物由SEQIDNO：25所示的InDel13正向引物和SEQIDNO：26所示的InDel13反向引物组成；InDel14引物由SEQIDNO：27所示的InDel14正向引物和SEQIDNO：28所示的InDel14反向引物组成；InDel15引物由SEQIDNO：29所示的InDel15正向引物和SEQIDNO：30所示的InDel15反向引物组成；InDel16引物由SEQIDNO：31所示的InDel16正向引物和SEQIDNO：32所示的InDel16反向引物组成；InDel17引物由SEQIDNO：33所示的InDel17正向引物和SEQIDNO：34所示的InDel17反向引物组成；InDel18引物由SEQIDNO：35所示的InDel18正向引物和SEQIDNO：36所示的InDel18反向引物组成；2CN115807115A权利要求书2/5页InDel19引物由SEQIDNO：37所示的InDel19正向引物和SEQIDNO：38所示的InDel19反向引物组成；InDel20引物由SEQIDNO：39所示的InDel20正向引物和SEQIDNO：4