一种鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN115927699A(43)申请公布日2023.04.07(21)申请号202210841263.X(22)申请日2022.07.18(71)申请人江西省农业科学院蔬菜花卉研究所地址330001江西省南昌市青云谱区南莲路602号(72)发明人袁欣捷方荣周坤华雷刚黄月琴陈学军(74)专利代理机构南昌丰择知识产权代理事务所(普通合伙)36137专利代理师吴称生(51)Int.Cl.C12Q1/6895(2018.01)C12N15/11(2006.01)权利要求书1页说明书6页序列表4页附图1页(54)发明名称一种鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记及其应用(57)摘要本发明公开了一种鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记及其应用，所述分子标记为SNPs分子标记组合，由PcRM07‑96、PcRM10‑233和PcRM12‑0.4组成，分别对应辣椒基因组的7号染色体96,534,770位置、10号染色体233,316,777位置和12号染色体494,846位置。利用本发明提供的分子标记及其扩增引物，结合特定的限制性内切酶处理，可在苗期快速、准确鉴定抗疫病辣椒种质，可用于辣椒抗疫病种质的分子标记辅助选择，提高育种选择效率，可准确高效的筛选出聚合不同抗源的抗疫病辣椒种质。CN115927699ACN115927699A权利要求书1/1页1.鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记，其特征在于，所述分子标记为SNPs分子标记组合，由PcRM07‑96、PcRM10‑233和PcRM12‑0.4组成，分别含有辣椒基因组的7号染色体96,534,770位置多态性为G/T、10号染色体233,316,777位置多态性为C/T和12号染色体494,846位置多态性为A/G的核苷酸序列。2.根据权利要求1所述的鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记，其特征在于，由C.annuumcv.CM334v1.6辣椒基因组的7号染色体96,534,770位置多态性为G/T的SNP，10号染色体233,316,777位置多态性为C/T的SNP和12号染色体494,846位置多态性为A/G的SNP组成。3.用于扩增权利要求1所述的鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记的引物对。4.根据权利要求3所述的引物对，其特征在于，具有SEQIDNO:1～6所示的核苷酸序列。5.根据权利要求3所述的引物对，其特征在于，PcRM07‑96、PcRM10‑233和PcRM12‑0.4标记的引物对分别为chr7‑96.5‑F1/chr7‑96.5‑R、chr10‑233.3‑F/chr10‑233.3‑R和chr12‑0.49‑F2C/chr12‑0.49‑R，分别具有SEQIDNO:1～2、SEQIDNO:3～4和SEQIDNO:5～6所示的核苷酸序列。6.含有权利要求3‑5任意一项所述引物对的检测试剂、基因芯片或含有所述检测试剂的试剂盒。7.权利要求1‑2任意一项所述的鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记或权利要求3‑5任意一项所述的引物对在鉴定抗疫病辣椒种质和分子标记辅助育种中的应用。8.一种利用权利要求1所述的分子标记鉴定辣椒抗疫病种质的方法，其特征在于，包括如下步骤：1)提取待测辣椒的基因组DNA；2)以待测辣椒的基因组DNA为模板，利用权利要求5所述的引物对扩增PcRM07‑96、PcRM10‑233和PcRM12‑0.4标记对应的SNPs位点，进行PCR扩增反应；3)分析扩增产物的SNP位点，PcRM07‑96位点碱基为GG的纯合基因型，PcRM10‑233位点碱基为TT或CT基因型，且PcRM12‑0.4位点碱基为GG或AG基因型，对应的辣椒种质为抗疫病种质。9.根据权利要求8所述的一种分子标记鉴定辣椒抗疫病种质的方法，其特征在于，步骤3)中所述的分析所述扩增产物的SNP位点为采用限制性内切酶酶切PCR扩增产物后，对酶切产物进行特征条带的电泳检测，判断所述SNPs位点碱基类型。10.根据权利要求9所述的一种分子标记鉴定辣椒抗疫病种质的方法，其特征在于，所述限制性内切酶分别为特异性识别AGCT的限制性内切酶AluI，特异性识别CCTCN7的限制性内切酶MnlI，和特异性识别TCGA的限制性内切酶TaqI。2CN115927699A说明书1/6页一种鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记及其应用技术领域[0001]本发明涉及分子标记检测技术，具体地说，涉及一种鉴定抗疫病辣椒种质的分子标记及其应用。背景技术[0002]辣椒疫病(Phytophthorablight)是由疫霉菌(PhytophthoracapsiciL.)侵染引起的一种土传性病害，自1918年在美国新墨西哥州被首次发现以来(Leonian,1922)，辣椒疫病就成为制约辣椒生产的一种毁灭性病害。中国是辣椒种