与玉米热带锈病（玉米壳锈菌）抗性相关联的基因座.pdf

(19)中华人民共和国国家知识产权局*CN103108541A*(12)发明专利申请(10)申请公布号(10)申请公布号CNCN103108541103108541A(43)申请公布日2013.05.15(21)申请号201080060463.7(51)Int.Cl.(22)申请日2010.11.03A01H5/10(2006.01)C12Q1/68(2006.01)(30)优先权数据61/257,9772009.11.04US(85)PCT申请进入国家阶段日2012.07.02(86)PCT申请的申请数据PCT/US2010/0552422010.11.03(87)PCT申请的公布数据WO2011/056836EN2011.05.12(71)申请人纳幕尔杜邦公司地址美国特拉华州申请人先锋国际良种公司(72)发明人S·C·K·米拉赫V·拉卡M·G·布特勒伊勒E·林伯格E·D·O·阿尔贝斯(74)专利代理机构中国专利代理(香港)有限公司72001权利要求书2页权利要求书2页说明书37页说明书37页代理人李慧惠李炳爱序列表69页序列表69页附图8页附图8页(54)发明名称与玉米热带锈病（玉米壳锈菌）抗性相关联的基因座(57)摘要本发明涉及用于鉴定具有提高的或降低的热带锈病抗性的玉米植株的方法和组合物。所述方法使用分子标记以鉴定并选择具有提高的热带锈病抗性的植株或鉴定并反选具有降低的热带锈病抗性的植株。通过本发明方法产生的玉米植株也是本发明的一个特征。用于关联等位基因变异与受关注性状的方法也是受关注的。CN103108541ACN103854ACN103108541A权利要求书1/2页1.选择具有增强的热带锈病抗性的玉米植株的方法，包括：a.在所述玉米植株中检测第一标记等位基因，所述第一标记等位基因与以下序列连锁并关联：i.PHMTR的位点16处的“T”缺失；或ii.参考序列SEQIDNO：167的位点337-339处的“GAG”单倍型；以及b.选择具有所述第一标记等位基因的所述玉米植株。2.权利要求1的方法，其中在单一减数分裂图谱上，所述第一标记等位基因与PHMTR的位点16处的“T”缺失或参考序列SEQIDNO：167的位点337-339处的“GAG”单倍型连锁20cM。3.权利要求1的方法，其中在单一减数分裂图谱上，所述第一标记等位基因与PHMTR的位点16处的“T”缺失或参考序列SEQIDNO：167的位点337-339处的“GAG”单倍型连锁2cM。4.选择具有增强的热带锈病抗性的玉米植株的方法，包括：a.在所述玉米植株中检测i.PHMTR的位点16处的“T”缺失；或ii.参考序列SEQIDNO：167的位点337-339处的“GAG”单倍型；以及b.选择具有PHMTR的位点16处的“T”缺失或参考序列SEQIDNO：167的位点337-339处的“GAG”单倍型的所述玉米植株。5.鉴定显示增强的热带锈病抗性的玉米植株的方法，所述方法包括在玉米植株中检测标记基因座，其中：a.将包含全部或部分所述标记基因座或其互补序列的标记探针在严格条件下与所述连续DNA杂交，所述连续DNA介于以下序列之间并包括以下序列：SEQIDNO：89或基于ClustalV比对方法与SEQIDNO：89具有95％同一性的核苷酸序列、以及SEQIDNO：96、或基于ClustalV比对方法与SEQIDNO：96具有95％同一性的核苷酸序列；并且b.所述标记基因座包含与所述增强的热带锈病抗性相关联的至少一个等位基因。6.鉴定显示增强的热带锈病抗性的玉米植株的方法，所述方法包括在所述玉米植株的种质中检测标记基因座的等位基因，其中：a.所述标记基因座位于染色体区间内，所述染色体区间包含并侧接PHM15590和PHM9535；并且b.所述等位基因与增强的热带锈病抗性相关联。7.权利要求6的方法，其中所述标记基因座位于染色体区间内，所述染色体区间包含并侧接PHM15590和PHM15721。8.权利要求6的方法，其中所述标记基因座位于染色体区间内，所述染色体区间包含并侧接C0041和C00428。9.鉴定显示增强的热带锈病抗性的玉米植株的方法，所述方法包括在所述玉米植株的种质中检测在一个或多个标记基因座处包含等位基因的单倍型，其中：a.所述一个或多个标记基因座位于染色体区间内，所述染色体区间包含并侧接PHM15590和PHM9535；并且b.所述单倍型与增强的热带锈病抗性相关联。2CN103108541A权利要求书2/2页10.权利要求9的方法，其中所述一个或多个标记基因座位于染色体区间内，所述染色体区间包含并侧接PHM15590和PHM15721。11.权利要求9的方法，其中所述一个或多个标记基因座位于染色体区间内，所述染色体区间包含并侧接C0041和C004