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本发明公开了一种高通量抗污染反渗透复合膜及其制备方法,包括依次设置的反渗透基膜、亲水骨架层及抗污染涂层;制备方法为:(1)将亲水骨架材料的水相分散液倾倒在反渗透基膜表面,使水相分散液均匀浸没膜表面,浸没处理后在反渗透基膜表面得到亲水骨架层;(2)涂覆抗污染涂层:将抗污染改性液倾倒在反渗透基膜上的亲水骨架层表面,静置吸附3~5min后,除去多余的溶液,经热处理后得到所述高通量抗污染反渗透复合膜。本发明在抗污染涂层和反渗透基膜之间构建具有二维或三维孔道结构的亲水骨架层,形成水分子传输通道,从而在保证膜抗污染性能的同时,减少膜渗透通量的损失。