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本发明公开一种具有抗菌性能的羟基磷灰石微图形化表面制备方法,主要步骤包括:首先在硅材质基底上制备出具有微/纳尺度拓扑结构的框架;然后制备羟基磷灰石靶材;再制备羟基磷灰石超薄涂层;最后进行热处理得到。本发明制备出的微图形化表面提供了一种不依赖于化学成分或药物成分,单纯靠物理形貌及其尺寸效应而产生抗菌性能的非用药策略,由于不依靠抗生素等药物来获得抗菌效果,可有效避免病人产生药物过敏反应,大大减轻了病人的身体负担。