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一种基于高通量测序数据的HLA基因综合分析方法.pdf

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本发明公开了一种基于高通量测序数据的HLA基因综合分析方法,包括如下内容:步骤一,数据预处理:将DNA测序数据比对到参考基因组上,然后依据比对结果选择需要的部分序列形成文件,以作为下游分析的输入;步骤二,基于NGS测序比对结果的HLA分型方案iNeo?HLA?Qual,基于多算法在实际数据集中的表现进行加权整合的HLA分型方案;步骤三,根据read计数计算HLA分型表达量的方案iNeo?HLA?Quant;本发明将多算法在实际数据集中的表现进行加权整合,本发明不仅同时给出了定性、定量两种结果的下游分析,且将各种算法进行整合后在准确度上实现协同作用;提高了分析的准确性和数据的完善性。