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本发明提供了一种检测基因编辑水稻wx突变基因的方法,所述方法包括将待测核酸与Cas12a蛋白、gRNA和单链DNA报告子接触,检测由Cas12a蛋白切割单链DNA报告子产生的可检测信号,所述gRNA包括与Cas12a蛋白结合的区域和与靶核酸杂交的导向序列,从而检测所述基因编辑水稻wx突变基因,所述单链DNA报告子不与所述gRNA杂交;所述gRNA的序列如SEQIDNo.10或SEQIDNo.11所示。