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本发明涉及农业种植领域,尤其涉及一种旱田作物间作系统土壤温室气体排放的测定方法。所述测定方法包括:1)根据间作系统中不同作物的最小种植单元,准备长宽与作物种植密度匹配的顶箱和地箱;2)根据作物生育期内的最大高度,准备延长箱;3)试验开始前数天将所述地箱的一部分打入土壤中;4)将所述顶箱或所述顶箱和延长箱进行扣箱,密封,采集顶箱内气体;5)将采集的气体采用气相色谱仪测定同一气体样品中的N2O和CH4浓度;6)计算N2O排放通量和CH4吸收通量。本发明提供的旱田作物间作系统土壤温室气体排放的测定方法,能够提高对旱田作物间作系统土壤温室气体N2O排放和CH4吸收的监测精度。