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本发明公开了一种含有链霉菌的复合微生物菌剂,其特征在于,所述复合微生物菌剂包含链霉菌、淡紫紫孢菌、哈茨木霉;所述的链霉菌包含细黄链霉菌、密旋链霉菌、娄彻氏链霉菌;所述的链霉菌、淡紫紫孢菌、哈茨木霉的重量比为4?6:1?3:1;本发明制备的复合微生物菌剂各菌种合理配比,相互协同作用能够高效防治作物灰霉病和叶霉病;同时能刺激作物生长,提高作物产量和品质。