大豆芽菜相关性状QTL的关联定位.doc

大豆芽菜相关性状QTL的关联定位大豆芽菜是大豆种子在人工控制适宜的温度和水分条件下,经过萌芽生长而成的一种芽苗蔬菜,是我国的传统优质蔬菜,有着悠久的生产和食用历史。大豆芽菜相关性状多由多基因控制的数量性状,对这些数量性状进行定位,不仅能了解这些数量性状的遗传规律,所定位的数量性状位点(QTL)也能作为基因克隆的基础和分子标记辅助选择的依据。本研究选用大豆微核心种质为研究材料,进行了2年的重复实验。在对该群体大豆芽菜鲜产量、干产量、芽长、根长、成芽率和百粒重6个性状的表型变异分析基础上,利用138个SSR标记对这6个性状进行关联定位分析。主要结果如下：1.大豆芽菜鲜产量、干产量、芽长、根长、成芽率和百粒重6个性状的变异范围十分广泛,品种间差异达极显著水平,适于进行关联分析。相关分析表明,大豆芽菜鲜产量与其他5个性状显著相关,初步筛选出14份鲜产量较高的材料。2.138个SSR标记在243份大豆材料中共检测出752个等位变异,每个标记检测出2-16个等位变异,平均5.45个。每个位点的多态性信息量(PIC)变化为0.204-0.864,平均为0.569,其中引物Sat074位点的PIC最大为0.864,引物Satt405位点的PIC最小为0.204。3.在20个连锁群上138个SSR位点的9453种两两位点组合中,不论共线性组合,还是非共线性组合,都有一定程度连锁不平衡(LD)存在。不平衡程度D>0.5的组合数较少,仅占总位点组合的0.18%,得到统计概率(P<0.01)支持的不平衡成对位点占总位点组合的12.01%。在此基础上选取57个没有明显LD的标记,使用Structure2.2软件进行群体结构分析,将243份材料分为2个亚群,以此作为群体校正的协变量进行关联分析。P<0.05且两年均能检测到的位点一共有28个,其中有9个位点同时与两个性状相关,1个位点与三个性状相关。4.对P<0.01且两年均能检测到的11个标记位点进行优异等位变异发掘。从8个与百粒重相关的标记位点中筛选出6个优异等位变异,2个与大豆芽菜鲜产量相关标记位点中筛选出3个优异等位变异,1个与芽长相关标记位点中筛选出2个优异等位变异,1个与成芽率相关的标记位点中筛选出1个优异等位变异。