一种用于藓类植物的DNA条形码clpP及其应用.pdf

(19)国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号CN116004661A(43)申请公布日2023.04.25(21)申请号202211740861.4C12N15/11(2006.01)(22)申请日2022.12.30(71)申请人河北师范大学地址050000河北省石家庄市南二环东路20号(72)发明人石硕沈风娇李琳豆建丛张士佳赵建成(74)专利代理机构石家庄领皓专利代理有限公司13130专利代理师吴瑾(51)Int.Cl.C12N15/29(2006.01)C12Q1/6895(2018.01)C12Q1/686(2018.01)C12Q1/6869(2018.01)权利要求书1页说明书6页序列表（电子公布）附图2页(54)发明名称一种用于藓类植物的DNA条形码clpP及其应用(57)摘要本发明涉及分子生物学技术领域，提出了一种用于藓类植物的DNA条形码clpP及其应用，所述DNA条形码clpP由clpP基因片段组成，用于获得所述DNA条形码clpP的引物序列如SEQIDNO1和SEQIDNO2所示，所述DNA条形码clpP用于鉴定藓类植物，还用于构建藓类植物系统发育树。通过上述技术方案，解决了现有技术中用于藓类植物的DNA条形码通用性不佳或分辨率不高的问题。CN116004661ACN116004661A权利要求书1/1页1.一种用于藓类植物的DNA条形码clpP，其特征在于，所述DNA条形码clpP由clpP基因片段组成。2.用于获得权利要求1所述的DNA条形码clpP的引物，其特征在于，所述引物的核苷酸序列如SEQIDNO1和SEQIDNO2所示。3.权利要求1所述的DNA条形码clpP在鉴定藓类植物中的应用。4.权利要求1所述的DNA条形码clpP在构建藓类植物系统发育树中的应用。5.一种用于鉴定藓类植物的方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、从待鉴定藓类植物中提取基因组DNA；S2、以待鉴定藓类植物的基因组DNA为模板，用权利要求2所述的引物进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；S3、将S2得到的PCR扩增产物进行测序；S4、构建系统发育树，鉴定藓类植物。6.根据权利要求5所述的用于鉴定藓类植物的方法，其特征在于，所述S2中，PCR扩增的反应程序为：80℃预变性5min，95℃变性1min，48℃退火1min；65℃延伸4min，共35个循环，65℃终延伸5min。7.根据权利要求5所述的用于鉴定藓类植物的方法，其特征在于，所述S4中，构建系统发育树的方法为最大似然法、贝叶斯分析法和邻接法。2CN116004661A说明书1/6页一种用于藓类植物的DNA条形码clpP及其应用技术领域[0001]本发明涉及分子生物学技术领域，具体的，涉及一种用于藓类植物的DNA条形码clpP及其应用。背景技术[0002]藓类植物是植物界由水生向陆生过渡的高等植物类群，具有重要的生态学价值、观赏价值和医药价值。藓类植物的种类繁多，全世界现有藓类植物约23000种，因此，很难通过形态特征对藓类植物进行准确鉴定。[0003]随着分子技术的快速发展和应用，DNA条形码技术极大的提高了对生物物种界定的准确性，广泛应用与藓类植物系统发育及进化研究中。现有技术中，针对藓类植物开展DNA条形码的研究相对较少，且研究中提出的用于藓类植物的DNA条形码具有通用性不佳或分辨率不高的问题，不适合作为藓类植物的专用DNA条形码。因此，亟需研究出藓类植物通用的高分辨率DNA条形码。发明内容[0004]本发明提出一种用于藓类植物的DNA条形码clpP及其应用，解决了现有技术中用于藓类植物的DNA条形码通用性不佳或分辨率不高的问题。[0005]本发明的技术方案如下：本发明提出了一种用于藓类植物的DNA条形码clpP，所述DNA条形码clpP由clpP基因片段组成。[0006]本发明还提出了用于获得所述DNA条形码clpP的引物，所述引物的核苷酸序列如SEQIDNO1和SEQIDNO2所示。[0007]本发明还提出了所述DNA条形码clpP在鉴定藓类植物中的应用。[0008]本发明还提出了DNA条形码clpP在构建藓类植物系统发育树中的应用。[0009]本发明还提出了一种用于鉴定藓类植物的方法，包括以下步骤：S1、从待鉴定藓类植物中提取基因组DNA；S2、以待鉴定藓类植物的基因组DNA为模板，用核苷酸序列如SEQIDNO1和SEQIDNO2所示的引物进行PCR扩增，得到PCR扩增产物；S3、将S2得到的PCR扩增产物进行测序；S4、构建系统发育树，鉴定藓类植物。[0010]作为进一步的技术方案，所述S2中，PCR扩增的反应程序为：80℃预变性5min，95℃变性1min，48℃退火1min；65℃延伸4min，共35个循环，65℃终延伸5min。[00