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一种治疗幽门螺杆菌中药单体组合物及其制备方法和应用,步骤为:a.溶解药物:将小檗碱、吴茱萸春碱、牛蒡子苷元、丹参酮Ⅰ分别溶解于无水乙醇中;b.组合药物:将上述制得的乙醇溶液,按小檗碱、吴茱萸春碱、牛蒡子苷元、丹参酮Ⅰ质量比6:1:(0.75?6):(0.75?6)混合在一起,即得到组合物。本发明成功制备一种治疗幽门螺杆菌中药单体组合物,该组合物在体内体外对幽门螺杆菌均具有非常明显的抑制作用,且作用专一,毒性低,不容易产生耐药。