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本发明公开了一种光固化抗菌低聚物及其制备方法和应用。现有抗菌3D打印材料粘度大、机械性能不好。本发明首先将二异氰酸酯、阻聚剂和催化剂,搅拌升温至30~55℃,3~5小时内均匀加入含丙烯酸单体,搅拌反应制得异氰酸酯?丙烯酸酯;然后将溶剂、氯化胆碱、阻聚剂和催化剂搅拌升温至30~55℃,1小时内均匀加入异氰酸酯?丙烯酸酯,将反应后得到透明液体减压蒸馏分离,得到抗菌低聚物。将制得的抗菌低聚物、光引发剂、活性稀释剂、填料等均匀混合即得到抗菌3D打印材料。本发明方法反应充分,工艺相对简单,易于实现,可根据材料的需求,设计不同官能度的抗菌低聚物,且季铵盐离子抗菌效果优良,且原料价格低廉,抗菌效果良好。