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一种产氢厌氧菌及其在高碱性条件下发酵产氢的方法,该产氢厌氧菌是从海底污泥中分离筛选出来的杆状嗜碱性梭菌ClostridiumP21;该方法包括配备用于包括底物和辅料的液体培养基;对液体培养基高温灭菌,去除液体培养基中残存氧气的处理;将液体培养基放入具有搅拌器的发酵罐中,设置发酵温度为30℃?80℃之间的一个温度,并且通过酸溶液和碱性溶液控制发酵罐在发酵周期内的pH值恒定为8?12中的一个值;在发酵罐中加入嗜碱性梭菌母液进行产氢输出,其中,嗜碱性梭菌母液的浓度为1?8%。因此,本发明可以提高生产氢气的产率,能量转换效率高,且氢气提纯非常容易,很好地解决了氢燃料电池在工业应用中的安全性问题。