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本发明提供了一种基于二阶段模糊C算法的低压分布式光伏系统不良数据检测方法和系统,通过采集光伏出力数据对应的气象数据,构建气象数据向量集,并通过一阶段模糊C聚类分析,按照各时刻光伏出力的气象数据所属簇类,标记气象环境标签。在二阶段模糊C聚类过程中,将光伏出力数据与气象环境标签组合构建数据集合,依据偏离指标选择最佳聚类数,让二阶段聚类划分与一阶段的聚类划分尽可能贴合。根据最终光伏有功出力的划分簇类,依次剔除最外围数据,并绘制平均距离指标DAVE的下降曲线,依据肘部法原则检测不良数据。本发明可以准确检测出传输到数据存储端的部分不良数据,降低其对光伏系统的特性分析以及出力预测的影响。