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本发明提供一种基于贝叶斯的盾构隧道掌子面失稳预警方法及系统,包括以下步骤:步骤1:建立目标隧道当前施工进度下的三维有限元模型;步骤2:采集既有场地数据集以及目标隧道场地数据集;步骤3:确定既有信息和当前约束信息;步骤4:采用马尔科夫链蒙特卡洛方法计算既有信息的超参数;步骤5:采用马尔科夫链蒙特卡洛方法计算目标隧道随机场参数;步骤6:基于随机场参数生成随机场,并建立三维随机有限元模型;步骤7:计算掌子面失稳概率,当失稳概率超过报警阈值时则输出报警信息,若否则退出。本发明考虑土体参数空间变异性和特定场地特性,采用贝叶斯方法对盾构隧道掌子面稳定性进行超前预警,保障盾构施工安全。