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本发明属于分子生物学方法鉴定动物性别的技术领域,具体涉及一种鉴别角鳖性别的分子标记、引物对及其应用。基因组DNA同时如SEQIDNO:1和SEQIDNO:2所示序列的角鳖,鉴别为雌性;基因组DNA包含如SEQIDNO:2所示序列,不包含如SEQIDNO:1所示序列的角鳖,鉴别为雄性。基于本发明中提供的鉴别角鳖性别的分子标记鉴别角鳖性别的方法,该方法不受年龄和样本限制,成本低、操作简便、可进行大批量鉴定,鉴别快速、结果直观准确,避免了采用传统方法耗时长、成本高和易出错等缺点,可以快速且准确的对各个时期的角鳖进行性别鉴定,可缩短育种时间、大幅提高产量和降低饲养成本。