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本发明公开了一种基于全局信息融合的多模态医学图像融合方法,其步骤包括:1、对原始多个模态的医学图像进行色彩空间转换和图像剪切的预处理;2、建立在多个尺度通过融合模块进行交互的模态分支网络,并建立由Transformer构成的融合模块来合并多模态特征信息;3、建立重构模块,从多尺度的多模态特征合成融合图像;4、在公开数据集上训练并评估上述模型;4、利用训练好的模型实现医学图像融合任务。本发明通过Transformer融合模块和交互式模态分支网络能充分地融合多模态的语义信息,实现细粒度的融合效果,不仅很好地保留了原图像的结构和纹理信息,也改善了由于低分辨率医学图像引起的马赛克现象。