GeneBank数据库使用0.ppt

GenBank数据库结构GenBank数据库数据注释(www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)GenBank数据库结构GenBank数据库结构GenbankGenbank查找页面D31716CDsarerecurringunitsinpolypeptidechains(sequenceandstructuremotifs),theextentsofwhichcanbedeterminedbycomparativeanalysis.Molecularevolutionusessuchdomainsasbuildingblocksandthesemayberecombinedindifferentarrangementstomakedifferentproteinswithdifferentfunctions.D31716D3171611序列结束D31716GenBank数据记录GenBank数据记录GenBank数据库结构GenBank数据库结构GenBank数据库GenBank数据库注释内容LOCUSACCESSIONKEYWORDSSOURCEREFERENCEFEATURESORIGINGenBank数据库—数据库格式GenBank数据库—数据库格式(1)FASTA格式序列的提交GenBank数据库—数据库格式(1)GenBank数据库—数据库格式(2)GBFF文件格式GBFF格式GBFF格式头部－Locus行GBFF格式头部－Locus行GBFF格式头部－Locus行GBFF格式头部－Locus行GBFF格式头部－Locus行GBFF格式头部－Locus行GenBank分类码（GenBankDivision）GBFF格式头部－Locus行GBFF格式头部－DEFINITION行GBFF格式头部－DEFINITION行GBFF格式头部-ACCESSION行GBFF格式头部-ACCESSION行GBFF格式头部－VERSION行GBFF格式头部－VERSION行GBFF格式头部－KEYWORDS行GBFF格式头部－SOURCE行GBFF格式头部－REFERENCE行GBFF格式头部－REFERENCE行GBFF格式中部GBFF格式中部GBFF格式中部－FEATURESGBFF格式中部－FEATURESGBFF格式中部－FEATURESGBFF格式中部－特性表关键词GBFF格式中部－特性表关键词GBFF格式中部－特性表关键词GBFF格式中部－特性表关键词GBFF格式中部－LocationGBFF格式中部－LocationGBFF格式中部－LocationGBFF格式中部－LocationGBFF格式中部－Qualifiers常见的特性表关键词所使用的限定词常见的特性表关键词所使用的限定词(续)GBFF格式尾部－ORIGIN总结图C2.2人类某一EST克隆的Genbank(dbEST)7374EMBLEMBL的研究内容EMBL的研究内容EMBL数据记录EMBL数据库结构EMBL数据库结构EMBL数据库结构EMBL数据库记录注释代码和内容说明http://www.ebi.ac.uk/ena/8586相关文献数据库(DR)的说明EMBL数据库记录相关文献数据库(DR)的说明相关文献数据库(DR)的说明GeneralInformationAdditionalInformationAdditionalInformationSequencePrimaryAccession－头部PrimaryAccession－中部PrimaryAccession－尾部序列文件格式序列文件格式例子（Fasta）序列文件格式例子(GenBank)序列文件格式例子(GenBank)序列文件格式例子（GCG）序列文件格式例子（GCG）序列文件格式例子(ASN.1)ASN.1是NCBI用来存储和维护所有数据的格式基因组数据库的注释基因组注释工具基因组注释工具基因组注释工具微生物基因组序列合作注释工具WhatIsThere(WIT)在线提交序列（BankIt）在线提交序列（BankIt）在线提交序列步骤填写表单信息（1）填写表单信息（2）填写表单信息（3）填写表单信息（4）填写表单信息（5）填写表单信息（6）确认表单信息提交的序列序列提交工具(sequin)