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本发明属于猪遗传标记筛选领域,具体涉及MMP2基因多态性作为猪产仔数性状的遗传标记及应用。从MMP2基因内含子13上克隆得到遗传标记,序列如SEQIDNO:1或SEQIDNO:2所示。公开了猪MMP2基因内含子13上SNP位点及其SNP分型的检测方法,MMP2基因内含子13上存在一个等位基因(A/T)突变,引起BgIII?RFLP多态性。其中:TT基因型的头胎产活仔数显著高于TA基因型;AA基因型的经产死胎数显著高于TA基因型;AA基因型的总胎次死胎数极显著高于TA基因型;AA基因型的总胎次产活仔数显著高于TA基因型,TA基因型是减少死胎数有益基因型。可用于大白猪活产仔数和死胎数性状的检测。