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本发明公开了靶向线粒体的酰胺类化合物在制备抗真菌药物中的应用。所述靶向线粒体的酰胺类化合物的结构如式I所示:其中,R=4?Cl、4?CH3或3?OCH3。式I化合物具有优异的杀真菌活性,其单方或复方外用组合物由其单独或与其它杀真菌药物复配后加上至少一种适用于皮肤外用的辅料组成;所述单方或复方外用组合物中式I化合物的质量百分含量为0.2~1%;所述单方或复方外用组合物可以制成凝胶剂或乳膏剂使用,对于治疗耳念珠菌、近平滑念珠菌、热带假丝酵母菌、苏丹毛癣菌、须癣毛癣菌等具有优异的效果。