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本发明提供一种防治大蒜病害的生防菌剂及其制备方法与应用。该生防菌剂是由铜绿假单胞菌和枯草芽孢杆菌组成的复合菌剂,经单菌发酵后,2种单菌发酵液按比例混合后制成。其中铜绿假单胞菌的命名为Pseudomonasaeruginosa,已于2020年12月1日保藏于中国普通微生物菌种保藏管理中心,保藏编号为CGMCCNO.21276。本发明的生防菌剂用水稀释后,与土壤以适当比例混匀和泥,取和匀的泥土包裹蒜种用于大蒜播种。本发明的大蒜生防菌剂能够有效抑制大蒜的病原细菌和病原真菌的生长,可应用于防治由病原菌引起的大蒜病害。