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本发明涉及一种抗菌水凝胶及其制备方法和应用,涉及生物医药领域。该水凝胶包括水凝胶溶液、药物载体和药物活性成分,制备原料包括:3份?20份QCSG、1份?20份rColMA、0.05份?5份光引发剂、90份?110份溶剂。将壳聚糖季铵盐溶于水,滴加甲基丙烯酸缩水甘油酯进行反应,过滤,取滤液,透析,冻干,得到QCSG;将重组胶原蛋白溶于水,滴加甲基丙烯酸缩水甘油酯进行反应,透析,冻干,得到rColMA。该水凝胶能够有效抑菌,具有优异的抗菌抗炎性,同时该抗菌水凝胶生物相容性更好,并具有合适的溶胀率、稳定的流变性能、缓慢的生物降解性、适当的力学性能和药物的持续释放性,可广泛应用于载药系统。