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本发明属于生物医用材料领域,具体涉及一种Ti基医用抗菌纳米复合涂层及其制备方法。本发明提供的Ti基医用抗菌纳米复合涂层,包含以下体积百分含量的组分:Ti95~99%,抗菌粒子1~5%;所述抗菌粒子为Cu或Ag。本发明采用Cu或Ag粒子作为Ti基医用抗菌纳米复合涂层中的抗菌粒子,同时限定抗菌粒子的含量,使得所述Ti基医用抗菌纳米复合涂层在具有良好生物相容性的前提下,具有良好的抗菌性能,实施例的数据表明,本发明所述Ti基医用抗菌纳米复合涂层对具核梭杆菌的抗菌率均在80%以上,且毒性等级为I级,符合生物材料安全标准,可以作为牙种植体的抗菌涂层。