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本发明公开了蛋白ATNDX、编码蛋白ATNDX的DNA分子在调控植物耐盐碱中的应用。本发明提供的蛋白ATNDX为如下(1)或(2):(1)由序列表中SEQIDNo.2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(2)与序列表中SEQIDNo.2限定的氨基酸序列具有80%或80%以上同一性,来源于玉米且具有相同生物学功能的蛋白质。本发明为阐明蛋白ATNDX在植物盐碱逆境信号应答中的分子机制提供了理论依据,为培育和改良抗逆性植物新品种提供了基因资源。