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本发明公开了一种靶向肿瘤部位的荧光磁共振双模态成像纳米探针,其通过以下方法制备得到:1)制备Fe3O4纳米颗粒;2)制备NPAPF?Fe3O4复合纳米颗粒:3)在复合纳米颗粒的表面修饰PEG。本发明利用AIE染料NPAPF的聚集态荧光增强的特性,通过简单的制备工艺,在制备NPAPF纳米颗粒的过程中装载用于磁共振成像探针Fe3O4纳米颗粒,形成NPAPF?Fe3O4复合纳米颗粒;并进一步采用PEG进行表面修饰,获得了能靶向肿瘤部位的荧光磁共振双模态成像纳米探针,在兼具磁性靶向功能的荧光和MR双模态成像功能的同时,还具备良好的生物相容性,合成工艺操作简单,并且没有多余的载体增加机体代谢负担。