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本发明涉及医用信息处理系统、医用信息处理方法以及存储介质,不受针对问诊的回答的不安定性影响而对患者进行诊疗。实施方式的医用信息处理系统具有取得部、推断部以及输出控制部。上述取得部取得表示针对诊疗对象者的医学检查结果的检查数据以及表示针对上述诊疗对象者的问诊的回答结果的回答数据。上述推断部通过对第1模型输入上述诊疗对象者的上述检查数据,由此推断与上述诊疗对象者的诊疗相关的信息。进而,上述推断部通过对第2模型输入上述诊疗对象者的上述检查数据以及上述回答数据,由此推断与上述诊疗对象者的诊疗相关的信息。上述输出控制部经由输出部输出上述第1模型的第1推断结果以及上述第2模型的第2推断结果。