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提供了用于处理载玻片上的样本的方法和设备。毛细处理模块具有用于升高和降低载玻片的曲柄,和/或用于将流体施加到载玻片的侧入口。当曲柄已降低载玻片时,在载玻片和毛细处理模块的腔室底板之间形成毛细间隙。毛细作用使流体通过毛细空间扩散到处理区域上并接触样本。当曲柄升高载玻片时,由于毛细间隙被消除,流体从载玻片的处理区域中撤回。