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本申请提供了更新文件系统的方法、装置、电子设备及存储介质。本申请的方法对Xen虚拟化平台下的任一虚拟机的文件系统进行拆分得到N个子文件系统;将N个子文件系统存储在K个系统分区;在对该文件系统进行更新的情况下,可以从该文件系统中确定待更新的目标子文件系统;进而对目标子文件系统进行更新。由于该虚拟机的N个子文件系统存储在K个系统分区,这样可以直接确定待更新的目标子文件系统,减少相关技术中确定待更新的目标子文件系统的文件对比的过程。这样可以减少对任意一个子文件系统进行更新的时间。