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本发明实施例公开了一种红外图像校正方法、系统及电子设备,应用于红外图像校正系统的FPGA处理器,所述方法包括:获取连续输入的红外图像数据;识别所述红外图像数据中的坏簇区域,其中,所述坏簇区域包括预设数量的坏点;构建目标矩阵,其中,所述目标矩阵包括所述坏簇区域;对所述目标矩阵的中心点进行预设替换处理,直至全部坏点完成所述预设替换处理。本发明提供的红外图像校正方法,能够自动识别红外图像中的坏簇区域,并基于构建目标矩阵的方式对于坏簇区域进行整体校正,在较低成本的情况下有效提升了红外图像探测设备的成像效果。