生物信息学期末复习题.docx

生物信息学期末复习题

第一篇：生物信息学期末复习题生物信息学复习题名词解释1、生物信息学:广义指生命科学与数学、计算机科学和信息科学等交汇融合所形成的一门交叉学科。它应用先进的数据管理技术、数学分析模型和计算软件对各种生物信息（特别是分子生物学信息）进行提取、储存、处理和分析，旨在掌握复杂生命现象的形成于演化规律。狭义专指应用信息技术储存和分析分子生物学数据，尤其是基因组序列产生的分子序列机器相关数据，也被称为分子生物信息学。2、人类基因组计划：是由美国科学家于1985年率先提出，于1990年正式启动的。美国、英国、法兰西共和国、德意志联邦共和国、日本和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。3、基因芯片：又叫DNA芯片，是一种高密度的寡聚核苷酸阵列。它采用原位组合合成化学和微电子芯片的光蚀刻技术等方法，将大量特定序列的ＤＮＡ片段直接固定在玻璃或硅衬底上，从而构成存储有大量信息的ＤＮＡ芯片。4、中心法则：是指遗传信息从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA，即完成DNA的复制过程。5、一级数据库：记录实验结果和做一些初步解释的数据库。名词辨析1)信息技术与生物信息学：信息技术（informationscience）是研究信息的获取、传输和处理的技术，由计算机技术、通信技术、微电子技术结合而成，即是利用计算机进行信息处理，利用现代电子通信技术从事信息采集、存储、加工、利用以及相关产品制造、技术开发、信息服务的新学科。生物信息学是研究生物信息的采集，处理，存储，传播，分析和解释等各方面的一门学科，它通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。信息技术和生物信息学都是高新技术，二者在新经济中并非此消彼长的关系，而是相辅相成，共同推进21世纪经济的快速发展。2)基因与基因组：基因是指具有遗传效应的DNA片段。而基因组指的是单倍体细胞中的全套染色体，或是单倍体细胞中的全部基因。3)相似性与同源性：相似性是指不同染色体之间基因序列的相似或相异程度。同源性是指两个核酸分子的核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。4)Blastn与Tblastn：blastn方法是用检测序列核酸搜索核酸序列数据库，它适合寻找分值较高的匹配，不适合远源关系。而tblastn是用检测序列蛋白质搜索由核酸序列数据库按6条链翻译成的蛋白质序列数据库。它适合寻找数据库中尚未标注的编码区。5)CDS与cDNA：CDS是内容分发服务的缩写，内容分发服务是互联网的一项新技术。与RNA链互补的单链DNA，以其RNA为模板，在适当引物的存在下，由RNA与DNA进行一定条件下合成的，就是cDNA。6)直系同源与旁系同源：直系同源指的是不同物种之间的同源性，例如蛋白质的同源性，DNA序列的同源性。旁系同源是那些在一定物种中的来源于基因复制的蛋白，可能会进化出新的与原来有关的功能。用来描述在同一物种内由于基因复制而分离的同源基因。7)敏感性与特异性：昆虫对某些低剂量的化学物质或其他物理因子能迅速地引起反应的特性。特异性是指成对、成组对象相互之间的必然对应选择关系。8)序列相似性比较与序列同源性分析：9)数据库搜索和数据库查询：数据库搜索在生物信息学中有特定的含义，它是指通过特定的序列相似性比对算法，找出核酸或蛋白质序列数据库中与检测序列具有一定程度相似性的序列。而所谓数据库查询，是指对序列、结构以及各种二次数据库中的注释信息进行关键词匹配查找。数据库查询有时也称为数据库检索，它和互联网上通过搜索引擎查找需要的信息是一个概念。简答题1)生物信息学数据库的组成包括哪些部分？数据库有哪些类型？答案：生物信息学数据库的组成包括一级数据库和二级数据库。数据库的类型包括核算和蛋白质一级结构序列数据库、基因组数据库、生物大分子三维空间结构数据库、以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。2)简要介绍GenBank中的DNA序列格式。答案：GenBank中的DNA序列格式可以分成三个部分，第一部分为描述符，从第一行LOCUS行到ORIGIN行，包含了关于整个记录的信息；第二部分为特性表，从FEATURES行开始，包含了注释这一纪录的特性，是条目的核心，中间使用一批关键字；第三部分是核苷酸序列的本身。3)简要介绍FASTA序列格式答案：FASTA格式，又叫Pearson格式，是最简单的，使用最多的格式。它的基本形式分为三个部分：⑴第一行：大于号（﹥）表示一个新的序列文件的开始，为标记符。后面可以加上文字说明，gi号，GenBank检索号，LOCUS名称等信息。⑵第二行：序列本身，为DNA的标准符号，通常大小写均可。⑶结束：无特殊标志，但建议多留一个空行，以