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本发明公开了一种低气味抗菌填料的制备方法以及包含该低气味抗菌填料的PET复合材料,该低气味抗菌填料的制备方法,包括以下步骤:(1)称取一定量的氢氧化钠、六水合硝酸钇、三异丙醇胺、去离子水,置于反应器皿中,搅拌反应,得混合液A;(2)将混合液A过滤、洗涤,置于马弗炉下煅烧,得介孔Y2O3;(3)称取一定量的介孔Y2O3、铝酸钠、硝酸镁、去离子水,置于反应器皿中,搅拌反应,得混合液B;(4)对溶液B进行过滤、洗涤、干燥,得到介孔Y2O3/铝酸镁类型的低气味抗菌填料。本发明的低气味抗菌填料,它能很好的改善PET的气味性和抗菌性能。