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本申请实施例涉及一种医学图像处理方法、装置、处理设备、存储介质,其中,所述方法包括:获取采集时间段内的脑部磁共振图像;提取所述脑部磁共振图像中所包含的多个体素分别在所述采集时间段内的时序信号;将所述多个体素对应的时序信号进行多模态分解,分别确定所述多个体素对应的模态信号集合;分别计算所述多个体素的模态信号集合之间的相似度,将所述多个体素中相似度满足预设要求的多个目标体素划分为相同的脑网络。本申请实施例提供的医学图像处理方法,可以并行对多个体素的时序信号进行多模态分解以确定所述时序信号对应的模态信号集合,这样可以减少计算时间,提高了脑部磁共振图像的分析效率。